Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms