Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SEMA4BQ9NPR2 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SEMA4BQ9NPR2 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SEMA4BQ9NPR2 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SEMA4BQ9NPR2 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SEMA4BQ9NPR2 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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