Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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