Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms