Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRDM12Q9H4Q4 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms