Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms