Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABARAPL3Q9BY60 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms