Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms