Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 MYH3-205ENST00000583535 6037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 DGCR2-206ENST00000545799 4484 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 ST8SIA1-203ENST00000396037 9714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 USP20-201ENST00000315480 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms