Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms