Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms