Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms