Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHY6

ZFP28, Zinc finger protein 28 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 868 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFP28Q8NHY6 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms