Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYRIPQ8NFW9 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYRIPQ8NFW9 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms