Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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