Protein–RNA interactions for Protein: Q8N319

C6orf223, Uncharacterized protein C6orf223, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf223Q8N319 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms