Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MED27Q6P2C8 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms