Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 C1S-201ENST00000328916 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 CHTF18-201ENST00000262315 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 UQCC1-201ENST00000349714 2188 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AL109618.1-201ENST00000434910 1683 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 TPTE-205ENST00000622113 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 RASAL1-201ENST00000261729 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 CEACAM20-201ENST00000611497 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 SERINC4-202ENST00000319327 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 FAM98A-202ENST00000403368 2818 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 BDNF-202ENST00000356660 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 BDNF-218ENST00000533246 4000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 SAP18-208ENST00000621421 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 DERL3-203ENST00000404056 3113 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 RBFOX1-208ENST00000547372 3524 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 SLC4A11-207ENST00000539553 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AL162231.4-201ENST00000564224 3264 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AP1B1-203ENST00000402502 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 VAT1L-201ENST00000302536 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 MAP2-201ENST00000199940 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 EBF2-201ENST00000408929 1888 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 MPP4-207ENST00000428900 2320 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 NR1D1-201ENST00000246672 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms