Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms