Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
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