Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP7Q16576 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms