Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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GABRA6Q16445 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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GABRA6Q16445 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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GABRA6Q16445 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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GABRA6Q16445 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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