Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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