Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 FAM157A-203ENST00000634862 6083 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
USF2Q15853 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 SIN3A-202ENST00000394947 6737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 PSMD11-201ENST00000261712 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 LRRC15-201ENST00000347624 5883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
USF2Q15853 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
USF2Q15853 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
USF2Q15853 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
USF2Q15853 AC012313.8-201ENST00000595059 5402 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
USF2Q15853 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
USF2Q15853 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
USF2Q15853 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
USF2Q15853 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
USF2Q15853 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
USF2Q15853 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
USF2Q15853 HEXA-201ENST00000268097 5252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
USF2Q15853 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
USF2Q15853 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
USF2Q15853 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
USF2Q15853 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
USF2Q15853 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
USF2Q15853 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
USF2Q15853 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
USF2Q15853 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
USF2Q15853 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
USF2Q15853 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
USF2Q15853 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
USF2Q15853 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
USF2Q15853 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
USF2Q15853 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
USF2Q15853 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
USF2Q15853 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
USF2Q15853 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
USF2Q15853 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
USF2Q15853 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
USF2Q15853 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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