Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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NEDD8Q15843 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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NEDD8Q15843 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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NEDD8Q15843 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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NEDD8Q15843 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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NEDD8Q15843 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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NEDD8Q15843 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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NEDD8Q15843 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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NEDD8Q15843 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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