Protein–RNA interactions for Protein: Q15828

CST6, Cystatin-M, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST6Q15828 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CST6Q15828 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CST6Q15828 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CST6Q15828 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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CST6Q15828 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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CST6Q15828 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CST6Q15828 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CST6Q15828 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CST6Q15828 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CST6Q15828 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CST6Q15828 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CST6Q15828 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CST6Q15828 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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