Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms