Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms