Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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