Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GAPVD1Q14C86 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
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