Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 297.9 ms