Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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