Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNW1Q13573 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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