Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
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