Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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