Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACACAQ13085 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms