Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RBBP4Q09028 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms