Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms