Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms