Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms