Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms