Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms