Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms