Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPL23P62829 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPL23P62829 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPL23P62829 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPL23P62829 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPL23P62829 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
RPL23P62829 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPL23P62829 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPL23P62829 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPL23P62829 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPL23P62829 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPL23P62829 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPL23P62829 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPL23P62829 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPL23P62829 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPL23P62829 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPL23P62829 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPL23P62829 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPL23P62829 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPL23P62829 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPL23P62829 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPL23P62829 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPL23P62829 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPL23P62829 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPL23P62829 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPL23P62829 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPL23P62829 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPL23P62829 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
RPL23P62829 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPL23P62829 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPL23P62829 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPL23P62829 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms