Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.5 ms