Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms