Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms