Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms