Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RANGAP1P46060 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RANGAP1P46060 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RANGAP1P46060 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RANGAP1P46060 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RANGAP1P46060 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RANGAP1P46060 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RANGAP1P46060 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RANGAP1P46060 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RANGAP1P46060 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RANGAP1P46060 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RANGAP1P46060 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RANGAP1P46060 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RANGAP1P46060 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RANGAP1P46060 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RANGAP1P46060 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RANGAP1P46060 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RANGAP1P46060 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RANGAP1P46060 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RANGAP1P46060 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RANGAP1P46060 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RANGAP1P46060 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RANGAP1P46060 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RANGAP1P46060 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RANGAP1P46060 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RANGAP1P46060 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RANGAP1P46060 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RANGAP1P46060 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RANGAP1P46060 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RANGAP1P46060 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RANGAP1P46060 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RANGAP1P46060 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RANGAP1P46060 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RANGAP1P46060 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RANGAP1P46060 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RANGAP1P46060 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RANGAP1P46060 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RANGAP1P46060 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RANGAP1P46060 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RANGAP1P46060 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RANGAP1P46060 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RANGAP1P46060 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RANGAP1P46060 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RANGAP1P46060 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RANGAP1P46060 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RANGAP1P46060 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RANGAP1P46060 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RANGAP1P46060 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RANGAP1P46060 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RANGAP1P46060 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RANGAP1P46060 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RANGAP1P46060 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RANGAP1P46060 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RANGAP1P46060 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RANGAP1P46060 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RANGAP1P46060 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RANGAP1P46060 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RANGAP1P46060 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RANGAP1P46060 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms