Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms